高通量测序技术,高通量测序是一种什么样的技术
来源:整理 编辑:五合装修 2023-05-09 00:06:26
1,高通量测序是一种什么样的技术
高通量测序是一种针对环境全基因组的测序技术,将环境样品中的DNA提取出,再用一定的引物进行扩增,获得的序列再进行数据库比对,最后获得微生物分类信息。
2,高通量测序的介绍
高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术(Next-generation sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。
3,DNA的高通量测序法
1、Roche 454合成法测序2、Solexa焦磷酸测序3、ABI SOLiD连接法测序4、Heli-Scope单分子合成测序(不需要使用PCR技术)因为高通量测序的读长都比较短,所以需要将dna片段化,加接头,深度测序后,再进行拼接。
4,高通量测序技术中的高通量是什么意
打个比方,一代测序一次测序只能够对1个基因进行测序,而高通量测序能够一次检测几十甚至几百个基因,这就是高通量,同时产生的数据也很巨大,一代测序一次测几百bp,高通量测序一次测几个Gbp高通量测序技术(high-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术("next-generation" sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条dna分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。高通量大概意思就是一次能进行多个样品。
5,基因组高通量测序的技术发展
高通量测序平台(high-throughput_genome_sequence_database) 自从2005年454 Life Sciences公司(2007年该公司被Roche正式收购)推出了454 FLX焦磷酸测序平台(454 FLX pyrosequencing platform)以来,曾推出过3730xlDNA测序仪(3730xl DNA Analyzer)的Applied BioSystem(ABI)这家一直占据着测序市场最大份额的公司的领先地位就开始动摇了,因为他们的拳头产品毛细管阵列电泳测序仪系列(series capillary array electrophoresis sequencing machines)遇到了两个强有力的竞争对手,一个就是罗氏公司(Roche)的454 测序仪(Roch GS FLX sequencer),,另一个就是2006年美国Illumina公司推出的Solexa基因组分析平台(Genome Analyzer platform),为此,2007年ABI公司推出了自主研发的SOLiD 测序仪(ABI SOLiD sequencer)。这三个测序平台即为目前高通量测序平台的代表。在最近几年中,高通量测序技术已经由以凝胶板为基础的方法(例如“S放射标记测序手册、ABl 373、ABIPRISM 377、Li-corIR2型DNA测序仪)发展到毛细管测序仪(如ABI Prism 3100、3700和3730xl型DNA测序仪,Megabace1000和Megabace 5000)测序,已有关于制备DNA和测序的方法及设备的评论发表(Meldrum,2000a,b)。利用毛细管测序仪的转变解决了凝胶板技术内在的通路追踪问题,毛细管测序仪的自动化显著提高了处理量,同时提供了更长的可测序长度。这些进展显著增加了近些年产生的人类病原体的基因组数据。TIGR现在的尖端测序设备包括25台ABIPrism 3700DNA分析仪、24台AppliedBiosystems 3730xlDNA分析仪、6台ABIPrism 3100DNA分析仪。约有50个项目在同时进行。在2001年进行的测序反应超过了3 400 000个,而到2002年底已完成了6 000 000个反应。TIGR现今的测序能力为每年14 000 000个测序流程。
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